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微液滴數(shù)字PCR平臺(tái)
獨(dú)特的產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1加樣體積可調(diào) 加樣體積在20-50μL內(nèi)可調(diào),更多加樣量,意味著更高靈敏度
2樣品數(shù)量靈活 每張芯片可處理1 -8個(gè)樣本,靈活可調(diào),節(jié)省試劑耗材
3微滴數(shù)多 30μL樣本可制備約5萬(wàn)個(gè)均一穩(wěn)定的納升級(jí)液滴,線性范圍廣,為0-30萬(wàn)拷貝/樣本。
4微滴無(wú)需轉(zhuǎn)移 全封閉體系,操作簡(jiǎn)單,微滴生成后無(wú)需轉(zhuǎn)移,減少微滴損失
5封閉檢測(cè) 檢測(cè)時(shí)機(jī)器封閉運(yùn)行,確保PCR產(chǎn)物不暴露在空氣中,防止氣溶膠污染和樣本損失,預(yù)防假陽(yáng)性
6單獨(dú)加樣 每個(gè)樣本獨(dú)立加樣控制,避免樣本間交叉污染
7信噪比高 相比成像方法,基于PMT進(jìn)行信號(hào)檢測(cè),容易判讀,結(jié)果準(zhǔn)確
檢測(cè)流程
液滴制備(5分鐘)+ PCR擴(kuò)增(1.5小時(shí))+ 檢測(cè)分析(25分鐘)= 2小時(shí)
數(shù)字PCR十大應(yīng)用
1基因表達(dá)差異研究
數(shù)字PCR可以提供比實(shí)時(shí)熒光定量PCR更精確的基因差異表達(dá)研究,尤其對(duì)于那些靶基因表達(dá)差異微小的情況,如:mRNA、microRNA、 IncRNAs等的表達(dá)分析;等位基因的不平衡表達(dá);單細(xì)胞基因表達(dá)分析;外泌體核酸分子定量分析等
2低豐度DNA模板分子的精確定量
由于絕大部分微液滴中只含單個(gè)或不含模板分子,使得低豐度DNA模板分子的擴(kuò)增不受高豐度模板分子擴(kuò)增的競(jìng)爭(zhēng)抑制,與此同時(shí),樣本中可能存在的抑制劑也在分配到微液滴的過(guò)程中進(jìn)行了相對(duì)稀釋,作用于單個(gè)微液滴內(nèi)模板擴(kuò)增的抑制劑數(shù)量大幅降低,從而提高PCR擴(kuò)增對(duì)抑制劑的耐受程度,因此可應(yīng)用于諸多臨樣本(如血液、尿液、糞便、痰液、胸腹水、 腦脊液等)中痕量核酸標(biāo)記物的檢測(cè)。一般而言, 定量PCR的檢測(cè)靈敏度約在1%, NGS的靈敏度可達(dá)到1%,而數(shù)字ECR的檢測(cè)下限可輕松實(shí)現(xiàn)0.01%
3拷貝數(shù)變異(CNV)研究
數(shù)字PCR直接讀取陽(yáng)性信號(hào),通過(guò)泊松分布校正得到目標(biāo)基因的絕對(duì)拷貝數(shù),為拷貝數(shù)變異的研究提供了絕對(duì)的檢測(cè)精度。采用數(shù)字PCR能夠有效對(duì)二代測(cè)序(NGS)和微陣列比較基因組雜交(aCGH)等實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,并具有 檢測(cè)周期短、成本低、樣本通量高等特點(diǎn)
4甲基化含量鑒定
傳統(tǒng)的亞硫酸氫鹽處理后的克隆測(cè)序法、抗體檢測(cè)法、定量PCR檢測(cè)法等受限于方法學(xué)的問(wèn)題,不能獲得甲基化程度的精確定量,而數(shù)字PCR 系統(tǒng)通過(guò)對(duì)樣本的微液滴處理及目標(biāo)分子的絕對(duì)拷貝數(shù)定量,為甲基化程度的精確定量檢測(cè)提供了一種可靠的技術(shù)
5二代測(cè)序輔助建庫(kù)
目前靶向測(cè)序建庫(kù)方法包括擴(kuò)增子方法,在均相溶液中,當(dāng)擴(kuò)增引物增加時(shí),由于擴(kuò)增引物之間的相互作用,從而影響擴(kuò)增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴(kuò)增,將可大大降低引物間相互作用,提高擴(kuò)增效率。同時(shí)還可以實(shí)現(xiàn)對(duì)于少量模板的有效擴(kuò)增,得到更多的有效測(cè)序數(shù)據(jù)
6 CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗(yàn)證
CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的 一大突破,但如何驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)是否成功,仍需要 高靈敏度的檢測(cè)方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團(tuán)隊(duì)發(fā)明了以 CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對(duì)核酸 進(jìn)行高靈敏度的定性檢測(cè),但精確定量評(píng)估時(shí) 仍采取了數(shù)字PCR進(jìn)行確認(rèn)
7無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前篩查
唐氏綜合征、地中海貧血或胎兒遺傳性耳聾基因檢測(cè)等,目前無(wú)創(chuàng)檢測(cè)標(biāo)本來(lái)源主要為孕婦 血液,檢測(cè)胎兒DNA會(huì)受到母體DNA的干擾, 依靠數(shù)字PCR可提高檢測(cè)準(zhǔn)確性。對(duì)比NGS, 數(shù)字PCR技術(shù)可以提高工作效率、降低檢測(cè)成本
8微生物(病毒、細(xì)菌等)的檢測(cè)
疾病預(yù)防控制中心、出入境檢驗(yàn)檢疫局系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室可以將基于TaqMan探針?lè)ǖ亩縋CR體系無(wú)縫地轉(zhuǎn)移到數(shù)字PCR上,從而滿足該類實(shí)驗(yàn)室對(duì)于檢測(cè)結(jié)果的要求:靈敏度更高、重復(fù)性更好、無(wú)需依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線的絕對(duì)定量結(jié)果
9腫瘤治療的伴隨診斷
常用體液來(lái)源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等) 的待檢標(biāo)本中的DNA,有正常脫落體細(xì)胞和病變脫落細(xì)胞兩種來(lái)源,前者的量遠(yuǎn)大于后者。通過(guò)微液滴處理能在每個(gè)微液滴中有效減少正常體細(xì)胞DNA的干擾,實(shí)現(xiàn)腫瘤標(biāo)記物的有效檢測(cè),如 EGFR, ALK, ROS1, KRAS、BRAF 等 基因的突變檢測(cè)、乳腺癌/胃癌的HER2基因擴(kuò)增檢測(cè)等,應(yīng)用于腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的伴隨診斷
10移植排斥監(jiān)控
接受肝臟移植的患者,目前用于檢測(cè)器官排斥反應(yīng)的常規(guī)方法是監(jiān)測(cè)患者血液中的生化指標(biāo)異常,一般情況下超過(guò)50%的移植器官功能已經(jīng)喪失。新的研究表明通過(guò)對(duì)七例術(shù)后移植患 者的移植物游離DNA進(jìn)行數(shù)字PCR檢測(cè),更早發(fā)現(xiàn)了兩例發(fā)生排斥反應(yīng)的患者,取得了令人 滿意的結(jié)果
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